Seminar: Informationssysteme (2SE)
| LVA-Nr.: | 365.013 |
| LVA-Leitung: | Werner Retschitzegger |
| Vorbesprechung: | Mo, 12.3.2007, 12:45-13:30, T 642 |
| Typ: | SE, 2h, Block |
| Anmeldung: | KUSSS (Anmeldung möglich bis 8.3.2007) |
Integration molekularbiologischer Daten in der Bioinformatik
Die Life Sciences werden das 21. Jahrhundert dominieren. Ist die komplexe Funktionsweise der Zelle verstanden, so können gegen eine Vielzahl von Krankheiten Gegenmittel entwickelt werden. Doch zur Zeit sind wir noch weit davon entfernt. Die Schlüsseltechnologie um diesem Ziel näher zu kommen ist die Bioinformatik. So war die Bioinformatik bei einem der eindrucksvollsten wissenschaftlichen Fortschritte der Menschheit, der Entschlüsselung des menschlichen Genoms, maßgeblich beteiligt. Trotz dieses Quantensprungs, der erst durch die Bioinformatik möglich gemacht wurde, steht die Wissenschaft in diesem Bereich erst am Anfang. Bedingt durch die thematische und räumliche Fragmentierung der weltweiten Forschung in eine Vielzahl von Gruppen, Firmen und Konsortien spielt dabei die Integration von Daten eine herausragende Rolle. Zu diesem Zweck wurden sowohl Lösungen entwickelt, die auf dem integrierten Zugriff auf verteilte Datensammlungen basieren, als auch solche, die das physikalische Kopieren der Ausgangsdaten in ein integriertes System vorsehen.Ziel dieses Seminarsist es, in Form von Gruppenarbeiten einen Überblick über die spezifischen Probleme der Datenintegration in der Bioinformatik zu geben. Es sollen von den unterschiedlichen Gruppen interessante Projekte und Produkte in diesem Gebiet vorgestellt werden und insbesondere auch neue Entwicklungen und offene Forschungsthemen behandelt werden. Basisliteratur:
- Körner, C., Kirsten, T., Do, H.-H., Rahm, E.: Hybride Integration von
molekularbiologischen Annotationsdaten. (Talk), Proc. 11th Conf. on Database
systems for Business, Technology and Web (BTW),Karlsruhe, 2005
http://btw2005.aifb.uni-karlsruhe.de/Folien/S073Koerner.pdf - Ulf Leser, Peter Rieger (2003): "Integration molekularbiologischer Daten",
Datenbankspektrum Ausgabe 6, (in German) pp. 56-66
http://www2.informatik.hu-berlin.de/wbi/publications/2003/db_spektrum.pdf - Zoe Lacroix, Terence Critchlow (eds.), Bioinformatics - Managing Scientific Data, Elesevier Science, 2003
- Rahm, E. (ed.): Data Integration in the Life Sciences. Springer-Verlag, Lecture Notes in Bioinformatics (LNBI) 2994, 2004